《幕后真兇》是一部以緝毒警察為題材的案件懸疑劇，劇情跨越了20多年，講述了兩代緝毒警察的故事。三十多年前，在松江土地上發生了一起生物制劑非法出境案，隨著此案的發生，緝毒刑警計春生失蹤，臥底警察楚江河生死不明，而作為案件核心的CH型生物試劑不翼而飛，此案成了一樁懸案。而就在二十多年后的現在，當年的緝毒支隊成員高平率領著楚江河的兒子楚白以及一眾干警勢要查清當年的真相，化工廣場大爆炸、四名被綁架的孩子、同一時間互相殺人的死者、摩天輪焚尸等一系列奇案的發生讓真相逐漸浮出水面，但隨著接近真相，一直藏在暗中的那雙手使這樁跨越二十余年的大案更加撲朔迷離起來，隨著刑警米樂兒的失蹤，眾人這才意識到，藏在黑暗背后的那雙手，竟然是“他”！最終，這個塵封20年的大案終于偵破，而背后的真正元兇卻是誰也未曾猜想到的。可無論如何，楚白完成了自己的夢想，為當年臥底的父親正名，讓父親住進了烈士陵園，而自己，最終繼承了父親的警號。